Simulations en Tomographie d'Emission
Les simulations Monte Carlo sont actuellement très utilisées en tomographie d'émission monophotonique (TEMP) et de positons (TEP). Elles permettent en effet de génerer
des données TEMP et TEP réalistes, dont on connaît exactement les caractéristiques, et autorisent par conséquent
des travaux de validation et d'évaluation très précis. S'il existe actuellement une dizaine de simulateurs PET et SPECT dans le monde,
la plupart ont été développés pour permettre la simulation de configurations d'imagerie bien particulières
(un type de caméra par exemple), et tous souffrent d'un manque de validation bien documentée.
Ce constat nous a conduit, dès 2001, à rassembler les forces de différents laboratoires européens fortement impliqués
en modélisation pour entreprendre le développement d'un nouveau simulateur générique permettant de simuler des acquistions
TEMP et TEP réalisées avec une grande variété de détecteurs. Ce fut le début du projet
OpenGATE.
Ce projet, dont les laboratoires fondateurs sont le groupe d'instrumentation en TEP de l'Université de Lausanne (Pr Christian Morel), le
laboratoire de Physique Corpusculaire de Clermont Ferrand (Vincent Breton), le groupe de traitement du signal
et de l'image en médecine de l'Université de Ghent et l'Unité 494 Inserm (maintenant Unité
678) (Irène Buvat), rassemble actuellement une vingtaine de laboratoires dans le monde entier. Il a donné lieu, en mai 2004, à la première distribution, dans le domaine public, d'un logiciel de simulation Monte Carlo, appelé GATE.
Ce logiciel repose sur la boîte à outils GEANT4 développée par une collaboration CERN, et dont la
pérénité est quasiment garantie compte tenu du très grand nombre de physiciens des particules et de physiciens
nucléaires faisant usage de ce code.
Actuellement, Irène Buvat est le porte parole de la collaboration OpenGATE, qui poursuit le développement du code GATE afin de l'enrichir de nouvelles fonctionnalités,
et valide également le code dans des configurations très variées d'imagerie TEMP et TEP réalisées chez l'homme ou le petit animal, aussi bien avec des tomographes
commercialisés qu'avec des prototypes.
Outre la coordination scientifique du projet OpenGATE, l'équipe participe activement aux développements de nouveaux modules pour GATE et à la validation du code.
L'équipe a par ailleurs une expérience importante concernant la modélisation Monte Carlo avec le logiciel SimSET, qu'elle a validé dans différents contextes.
Enfin, l'équipe a contribué à l'élaboration d'une base de données simulées par l'approche de Monte Carlo, distribuée dans le domaine public.
Pour en savoir plus...
Publications relatives à ces travaux
- I. Buvat, D. Lazaro. Monte Carlo simulations in emission tomography and GATE: an overview. Nucl. Instr. Meth. Phys. Res. in press, 2006. pre-print PDF
- S. Staelens, J. De Beenhouwer, D. Kruecker, L. Maigne, F. Rannou, L. Ferrer, Y. D'Asseler, I. Buvat, I. Lemahieu. GATE: improving the computational efficiency. Nucl. Instr. Meth. A sous presse, 2006. pre-print PDF
- I. Buvat, I. Castiglioni, J. Feuardent, MC. Gilardi. Unified description and validation of Monte Carlo simulators in PET. Phys. Med. Biol. 50, 329-346, 2005. version PDF
- I. Castiglioni, I. Buvat, G. Rizzo, M.C. Gilardi, J. Feuardent, F. Fazio. An open-to-public Monte Carlo database for validation purpose in Emission Tomography. Eur. J. Nucl. Med. Mol. Imaging. 32:1234-1239, 2005. version PDF
- K. Assié, I. Gardin, P. Vera, I. Buvat. Validation of the Monte Carlo simulator GATE for Indium 111
imaging. Phys. Med. Biol. 50, 3113-3125, 2005. version PDF
- D. Lazaro, I. Buvat, G. Loudos, D. Strul, G. Santin, N. Giokaris, D. Donnarieix, L. Maigne, V. Spanoudaki, S. Styliaris, S. Staelens, V. Breton. Validation of the GATE Monte Carlo simulation platform for modelling a CsI(Tl) scintillation camera dedicated to small-animal imaging
. Phys. Med. Biol., 49:271-285, 2004. version PDF
- K. Assié, V. Breton, I. Buvat, C. Comtat, S. Jan, M. Krieguer, D. Lazaro, C. Morel, M. Rey, G. Santin, L. Simon, S. Staelens, D. Strul, JM. Vieira, R. Van de Walle. Monte Carlo simulation in PET and SPECT
instrumentation using GATE. Nucl. Instr. and Meth. Phys. Res. A. 527:180-189, 2004. version PDF
- S. Jan, G. Santin, D. Strul, S. Staelens, K. Assié, D. Autret, S. Avner, R. Barbier, M. Bardiès,
P.M. Bloomfield, D. Brasse, V. Breton, P. Bruyndonckx, I. Buvat, AF. Chatziioannou, Y. Choi,
YH. Chung, C. Comtat, D. Donnarieix, L. Ferrer, SJ. Glick, CJ. Groiselle, D. Guez, PF. Honore,
S. Kerhoas-Cavata, AS. Kirov, V. Kohli, M. Koole, M. Krieguer, DJ. van der Laan, F. Lamare,
G. Largeron, C. Lartizien, D. Lazaro, MC. Maas, L. Maigne, F. Mayet, F. Melot, C. Merheb, E.
Pennacchio, J. Perez, U. Pietrzyk, FR. Rannou, M. Rey, DR. Schaart, CR. Schmidtlein, L.
Simon, TY. Song, JM. Vieira, D. Visvikis, R. Van de Walle, E. WieÔrs, C. Morel. GATE: a
simulation toolkit for PET and SPECT. Phys. Med. Biol. 49,4543-4561,2004. version PDF
- I. Buvat, I. Castiglioni. Monte Carlo methods in PET and SPECT. Quarterly J. Nucl. Med., 46: 48-59, 2002. version PDF
Contact
Irène Buvat : buvat@imed.jussieu.fr